APG系統究竟是什麼？

APG系統自發表至今已有4個版本，第一版發表於1998年 (APG I)，而後分別於2003 (APG II)、2009 (APG III)、2016 (APG IV) 年發表修訂版本。從各個版本的演進來看，被子植物在科和目這兩個位階的親緣關係已經漸趨穩定，許多難解的部分都獲得一定程度的解決，新的版本裡大幅更動的狀況已經減少很多，可預期的是未來的改版應該會朝向更細緻的方向進行。

APG系統是由被子植物種系發生學組 (Angiosperm Phylogeny Group) 利用分子生物學技術加上支序學原理所建構的一個分類系統。本系統的精神在於大幅的提高了分類系統的客觀性，因其並非一人一地之作，對於分類群的歸類也非主觀認定決定，而是由支序學的方法論而來，從這點看來，本系統確實是有其重要的貢獻。

就其內容來看，這個系統處理的對象在目和科這兩個位階，對於目以上的位階並不給予正式名稱，而以分支的名稱取代，例如真雙子葉植物分支、單子葉植物分支等。過去慣用的雙子葉植物的概念，在這裡被拆解為被子植物基群和真雙子葉植物，其中前者包括過去在一些系統裡認為比較原始的類群，例如木蘭科 (Magnoliaceae)、樟科 (Lauraceae)、無油樟科 (Amborellaceae) 或冬木科 (Winteraceae) 等。而後者則包括大部分過去我們熟知置於雙子葉植物中的類群。單子葉植物的部分因為是單系群的關係所以維持不變，但裡面的幾個科的變革很大。

變動比較大的幾個科包括百合科 (Liliaceae)、玄參科 (Scorphulariaceae)、錦葵科 (Malvaceae)、馬齒莧科 (Portulacaceae)、虎耳草科 (Saxifragaceae)、大戟科 (Euphorbiaceae)、紫草科 (Boraginaceae) 和忍冬科 (Caprifoliaceae) 等。有趣的是，這些科通常是從一個很大的科被拆成幾個較小的科，而很少有像錦葵科一般，是合併幾個科 (例如木棉科 Bombacaceae和椴樹科 Tiliaceae) 成為一個較大的科。這些科的細分使許多屬必須在科之間搬移，而前幾個版本中，這些科的狀態又極不穩定，這裏舉個例子說明這種現象：天門冬科 (Asparagaceae) 在第一版中仍然只是一個包括2個屬的小科，在第二版中成為了一個可以選擇性與7個科合併的詭異狀態，到了第三版才底定下來，把第二版中可以選擇性合併的科都併進來，成為一個非常大的科 (約2500種植物)。種種變動都是造成難以適應的原因，不過這種大變動未來應該會大幅減少。

不過APG系統難道就沒有缺點嗎？事實上，這應該從幾個面向談起，前面我們說過，本系統是以支序學的方法來定義各分類群，但也就造成了一些科在形態上難以定義的狀況，例如天門冬科在第三版之後的範圍很大，幾乎沒有可以用以定義的特徵，但由於要符合單系群的概念，這樣的範圍還是被留下來了。而這樣的方式，也造成這個系統在應用上的困難，例如現場的初步鑑定，有時很難單從形態上的特徵找到它歸屬的科別。
那我們應該怎麼來看待APG系統呢？其實說穿了，這也就是一個分類系統，嚴格說來與其他系統的地位並無二致，既然我們能夠理解其他系統對個別類群採取的概念和處理，那我們也可以同樣的態度來面對這個系統。並且，絕大多數APG系統的變動都不是新的，也就是說這些處理在過去就多少曾經被提及，只是我們不熟悉而覺得是新的而已。但APG系統確實是一個嶄新的變革，許多標本館也紛紛採用這個系統對館藏歸類，因此了解這個系統確實有其必要。