花粉壁的伸縮與調和作用
上次說到花粉的前處理對於花粉的影響，這次要談的是花粉本身的形態變異及附屬物對於花粉形態的影響，特別是外壁的形變和花粉鞘 (pollen kitt)，這兩者都是過去在拍攝花粉的時候比較少注意，但卻會大幅影響到觀察花粉形態的現象。
在上次的內容裡提過，花粉的外壁是由孢粉素構成，各位可能會想說，花粉由這麼堅硬的物質構成，應該很難產生形變，所以只要前處理得當，應該就不會有形態發生改變的問題。不過自然往往超出我們的想像，如果我們同時觀察光學顯微鏡和掃描式電子顯微鏡的影像可以發現，有的時候同一種植物可以發現不同的形態，這便是這次要談的主題之一，也就是調和作用 (harmomegathy) 的影響。調和作用指的是新鮮花粉的外壁會隨著含水量的多寡伸縮，進而產生形態變異的現象。我們知道，花粉在成熟之後，通常會因為各種外力的影響離開花藥，然後抵達另一朵花的柱頭。在傳播過程中，由於外界的濕度降低，外壁會有各種不同方式的皺縮關閉溝孔以減少水分散失，等到花粉抵達柱頭上後，因為濕度升高的緣故，花粉就再次充水恢復到膨潤的狀態。
這樣的現象會對我們觀察花粉發生什麼影響呢？首先，調和作用造成的外壁形變是固定的，而且根據研究，這種形態變異還可以分成幾個類別，所以調和作用前後的形態變化可以提供分類學的證據。此外，調和作用可能會讓某些花粉的特徵出現或消失，例如溝孔部分的表面雕紋會因為花粉失水、溝孔關閉的情況而無法觀察，特別是這些部位的雕紋常常與其他部位不同。因此若考量收集最多花粉特徵的前提，那麼調和作用的型式以及膨潤狀態下的花粉溝孔內的雕紋，也是必須拍攝觀察的重點。
那麼，除了調和作用以外，還有其他因素會使花粉表面的形態發生改變嗎？那當然，花粉的秘密比想像中的多太多了，所以就下次見囉～
本文最初於2020.6.18刊登於同名專頁
花粉前處理方法的一些比較
自古以來，花粉形態就是分類學者關注的特徵之一，由於花粉的量多、特徵相對穩定，又是繁殖器官的特徵，因此有關花粉形態的報導是相當的多。
近年來，觀察花粉形態多以掃描式電子顯微鏡為主，因為近年的成本降低，以及可以取得詳細的花粉表面特徵，所以為學者愛用。但在上機之前，樣本需要經過前處理，使其乾燥後才能以顯微鏡觀察，所以前處理的好壞就很大程度的影響了觀察的結果。
一般來說，常見的前處理方式包括酸解法或是酒精固定，兩者的共通點在於後續都需經過序列脫水及臨界點乾燥後，才能上機觀察。而兩者的差別在於，酸處理使用的通常是硫酸，由於掃描式電子顯微鏡觀察的主要是花粉的外壁 (exine)，而這些外壁通常是由孢粉素 (sporopollenin) 構成，不易被強酸破壞，所以強酸處理後內壁 (intine) 和細胞質的部分會被破壞，僅留下外壁。該方法的優點是可取得清晰且乾淨的外壁形態，但缺點也很多，例如實驗操作相對困難且危險，在過程中也可能流失大量的花粉。此外，由於並非所有植物的花粉表面都以外壁構成，例如樟科 (Lauraceae)、薑科 (Zingiberaceae) 等，這些種類的花粉表面主要以內壁構成，因此用酸解法處理後，花粉會被摧毀殆盡，因此要採用本方法前，最好先仔細的查閱文獻，並且仔細的觀看這些報告拍攝的花粉有無可疑之處，例如外觀雖然正常，但可能因為內壁被破壞而有塌陷的現象。
另外酒精固定的方式可以避免內壁塌陷的問題，實驗過程也比較安全，而且也適用於多數的類群，雖然不能完全去除細胞內部的物質，但若序列脫水做得好，標本乾燥的情況也可以達到一定的水準，因此可以取得良好的影像。雖然在此不必擔心內壁被破壞，但由於酒精固定和脫水的時間比較長，所以試驗花費的時間就比較長。
此外，有學者提出第三種方式，即使用2,2-dimethoxypropane (DMP) 來處理花粉，這個方法具有酒精處理的優點，即可以保留花粉內壁的完整性，且因為作用的方式與酒精不同，所以可以減少脫水過程中對花粉形態的影響，並且不需經過序列脫水，所以也可以減少前處理的時間，此外由於DMP的作用方式並非「脫水」，而是把水分子分解的方式，所以乾燥效果會很好，可以取得相當銳利且乾淨的影像。
另外也有一些花粉由於花粉壁較厚，可以抵擋拍攝過程中因為抽真空造成的壓力，所以可以直接不經前處理就上機拍攝，例如薊屬 (Cirsium) 植物即屬此類。因此若電子顯微鏡的試驗方便，也可以先以此法檢測目標物種是否屬於此類。
下次我會繼續談花粉這個主題，在於花粉本身形態變異的部分，敬請期待。
本文最初於2020.6.5刊登於同名專頁
一些採集的know how
談了這麼久的法規議題後，相信大家也被各種學名問題搞得昏頭轉向，所以這次來談談實務上的問題，也就是採集的規劃。分類研究者通常都非常喜歡採集活動，除了可以收集材料，同時也可以藉機看到很多不一樣的風景，說採集是分類學家的運動也不為過。但要怎麼安排採集，才能讓採集事半功倍呢？這就是這次的主題啦。
採集要有效率，那麼前置作業一定要做得很好。這裡所謂的很好不只是採集工具的準備，還包括採集地點的收集、行程規劃、標本的處理等環節。就採集地點的收集來說，標本館和文獻的資料一定不可少，若是許久之前的採集地點，則有必要確認該地區是否歷經開發，導致植物消失於該地。另外，早期的文獻或標本上的地點可能很簡略，如果該地點很重要的話，那麼可能要設法找出能夠用來推敲該採集者採集行跡的資料，例如採集記錄簿或日記。此外，由於現今在各大社群上有很多人會分享目擊情報，所以也可以向這些植物愛好者詢問採集地點，但必須注意的是，無論是否稀有，多數人都很介意公開採集地點會使植物遭到破壞，務必表明身份及採集用途，並且信守承諾。此外，也要考慮各物種的物候，例如花期果期或生長季極短的植物，特別是真菌異營或寄生性的植物，這些部位或種類通常生長季很短，因此就更需要精確的了解適合的採集時間。
另一方面，採集的數量以及保存方式也是事前作業中很重要的一環，例如相對應後續各種試驗的保存方式，以及各試驗所需的數量等。例如針對花粉形態的採集可能就要盡可能收集到新鮮的雄蕊，並且將之保存到對應的保存溶液中。若是分子生物學的研究，通常需要考慮是否需要族群採樣、標本處理及保存方式等。這部分又回歸到這個研究的目的以及相關的試驗設計是否完善，如果沒辦法規劃的很好，那麼有必要在採集之前再通盤檢討一次研究的試驗設計，以免收集到不符合預期的材料，造成浪費。
行程規劃方面，除了把採集地點串起來之外，也要考量每個地點採樣可能需要的時間，特別是需要現場處理樣本或是長時間拍照的狀況，但根據經驗，每個地點預留多一點時間，並且準備一些備用地點，通常就可以很有彈性的應付各種狀況了。
以上就是這次的內容啦，本來想說可以寫得短一點，但還是不小心變成大長篇，希望以上內容對各位的研究都能夠受用，那麼就下週見囉～
本文最初於2022.5.29刊登於同名專頁
再論名稱的合法與不合法
江戶時代的動植物圖譜：從珍貴的500張工筆彩圖中欣賞日本近代博物世界
唸過生物相關科系的朋友們，想必都對點圖這件事又愛又恨吧！我自己也是如此，大學時代不管是普通植物學或是樹木學都有這類繪圖的課程安排，但我本身是相當不會畫這類線繪圖的人，所以當發現有人可以畫出惟妙惟肖的繪圖時，我除了佩服還是佩服。但研究上來說，紀錄這些形態還是有必要的，畢竟描述寫得再好，常常都不如一張繪圖或照片來得傳神。那我既然無法有效精進繪圖這事，於是我就朝拍照這部分努力，還好我的天賦點數在這方面似乎好上許多。
記錄生物的外觀形態一直是人們認識這個世界的方法之一，在沒有攝影技術的時代，繪畫成了唯一的工具與途徑。江戶時代的日本人也不例外，這個時代的人們歷經了長久的戰亂，終於迎來了一個和平盛世，因此相較於過往，更有閒暇追求精神與物質上的滿足，因此在繪畫上，人們得以追求技法的精進。本書作者狩野博幸便從這個時代流傳下來的許多圖譜中，選擇了五百張非常精美的工筆畫，讓我們一窺江戶時代對於各種生物描繪的技法呈現與美感。
作者從狩野派與其長久流傳的寫生傳統說起，闡述這個流派如何影響後世的寫生傳統，然後從植物、鳥類、獸類、蟲類及魚貝類圖譜等依序介紹，每冊圖譜並附有作者簡介及成書年代。對於想要知道這些圖譜的由來的讀者相當方便，而且這些文字相當精要，因此不至於過於長篇大論而令人感到枯燥。而每張繪圖亦標示出所繪為何物，可以讓我們從現代的角度了解當時的人們所謂的「真實」是何種樣貌，另一方面，從這些圖譜也得以知道當時園藝或寵物賞玩的流行。若對上述內容都不感興趣，那麼光是細細的查看這些繪圖，就夠令人感到舒心的了。而出版社與印刷廠在印刷品質的堅持，忠實的呈現與還原這些繪畫的細節，都讓人能夠更投入在這本書帶來的欣賞體驗中。
我真的非常訝異台灣還有出版社願意出版這種製作起來費工，但其實可能讀者很少的書，因此我拿到書之後就立刻決定寫稿推薦，希望各位到書店去的時候可以多翻翻這本相當有古典美的繪本集。
本文最初於2020.5.6刊登於同名專頁
你看到的不確定真的是那種不確定嗎？
當我們在檢閱標本標籤的時候，常常可以發現標本標籤上有各種拉丁文的縮寫，其中比較常見的就是aff.和cf.這組縮寫。這兩個縮寫的用法很類似，都表示該標本有一定程度的不確定性，但兩者經常混淆，所以在此將之釐清。要注意的是，這組縮寫在不同學者的用法之間可能有些許不同，這裡的用法是參考Simpson (2019) 的Plant Systematics第三版上的說明。
aff.是拉丁文affinis的縮寫，意思是相關的 (related to)，可以標示為Haworthia aff. lockwoodii或aff. Haworthia lockwoodii。意思是這份標本跟H. lockwoodii有一定程度上的相似，但仍有不同，這分標本可能是一個不同甚至新的分類群。
cf.是拉丁文confer的縮寫，意思是比較 (compare)，同樣可以標示為Haworthia cf. lockwoodii或cf. Haworthia lockwoodii。意思是這份標本在鑑定上有困難，可能是文獻或參考標本的不可得，所以請和這個種類 (cf.後連接的學名)比較，隱含有”可能是這個種類”的意思。
此外，cf.也有參照的意思，有的時候在文獻中若要引用他人的觀點時，也會使用這個縮寫。
本文最初於2020.4.14刊登於同名專頁
從樟樹的學名演變來探討何謂「分類地位」
好的，又是一個普通的星期六，今天要來談一個很常見但又有點難懂的專有名詞—分類地位。
在這之前，先來看個案例：
樟樹的學名是Cinnamomum camphora (L.) J. Presl，眼尖的人可能注意到這是一個新組合，所以應該有個相對應的基本異名 (基礎名)，這裡案例的基礎名是Laurus camphora L.。
從以上的沿革來看，樟樹的學名由月桂屬 (Laurus) 轉移至樟屬 (Cinnamomum)，這樣的轉移，就可以稱作是分類地位的改變。因此，所謂的分類地位，指的是一個分類群在屬下或種下的位置，但就植物而言，我們通常也會想知道，這個屬在科內的位置，例如該屬根據新的證據，是屬於哪個科或是亞科、族等；又會是該種是屬於哪個亞屬、組或系等。分類地位就如同地圖上的指示一樣，告訴我們每個分類群的所在位置以及與相近的類群間的關係。所以就樟樹的的這個案例而言，樟樹是屬於樟科 (Lauraceae) 樟屬的植物，過去曾被置於月桂屬內。
了解一個分類群的分類地位的沿革，常是分類研究的第一步，因為這代表過去各研究學者如何看待該類群，當一個分類群的沿革越複雜，就代表它的分類地位有一定程度的爭議性，也代表這是一個值得深究的議題。至於為什麼植物分類學中經常以「科」為單位來理解分類地位的演變呢？這部分就留待以後解明囉～
本文最初於2019.10.19刊登於同名專頁
分類學議題是什麼？那可以吃嗎？
好的，我們終於又寫稿了，這陣子實在是想不到什麼有趣的議題來寫成稿件，想寫的議題感覺又過於艱澀，但有鑒於這個粉專一直以來都是走一個相當hard core (假裝親民) 的路線，所以就還是來一點硬硬的內容吧！
回顧以往寫的文章，我發現從來沒談論過分類學議題是什麼？還記得很久很久以前的開版文章，說到分類學的工作包括鑑定 (identification)、命名 (nomenclature)、歸類 (classification) 及敘述 (description) 嗎？簡單來說，只要是問的科學問題指涉到以上四個工作的其中之一者，都算是分類學議題。所以近似種的辨別算是分類問題 (鑑定問題)、討論某種植物的學名是否有需要轉移是分類議題 (命名問題)、討論某個屬的範圍是否需要重新界定是分類議題 (歸類問題)、某個類群在文獻中紀錄的花部形態有誤 (敘述問題)，這些議題都算是分類學議題。
不過就像在討論科學問題的時候常問的那個問題，在此也一樣適用，也就是：什麼樣的問題算是一個好的分類議題？答案其實也和好的科學問題一樣，需要有明確的問題內涵，而不是一個發散的問題結構。在此舉一個例子來說明：「百合科 (Liliaceae) 現在還有到底變成什麼樣子？」這是一個難以回答的問題，因為不知道問題所要問的目的是什麼 (雖然分類學者好像都很有默契的知道要回答APG系統的相關內容)？但如果換個方式來問，這問題大概就會比較明確：「百合科 (Liliaceae) 在APG系統中的範圍到底變成什麼樣子？」雖然APG系統有好幾個版本，但至少可以就APG系統裡百合科範圍的演變回答，問題變得具體許多。
除此之外，分類議題的內涵還可以繼續延伸到比較操作面的部分，這個就留待下次再談囉～
本文最初於2019.7.21刊登於同名專頁
一個新，各自表述
很快的，農曆新年一如往常的來臨，今年的假期還特別的長，不知道各位有什麼打算呢？既然新年快到了，那這次就來說說新的故事吧～
新這個字，在植物分類學的世界有三層意思，分別為新種、新紀錄種、新馴化種，三者各有巧妙，且聽我娓娓道來。
新種 (new species)：指的是從來沒有被人發現，首次被紀錄並描述的種類。新種在發表之初，通常僅於相當少數的生育地被發現，當時日漸長，不排除有發現更多族群的可能性。此外，新種的發表需要符合法規的規定，需有有效出版及正當出版。
新紀錄種 (new record species)：這個指的是某個地區的原生物種，但發現時已於其他地區發表，所以並非新種。這類植物通常數量稀少，或生長於難以發現的生育地，以致於難以發現。
新馴 (歸) 化種 (new naturalized species)：又稱為新歸化種，指的是某物種經由人為活動，有意或無意的引入某地區，造成該種類在非原生地的環境中生長。這類植物通常來自遙遠的地區，並且常發現於人類活動的區域附近
很多馴化種在經過幾個世代之後，由於無法與當地的原生物種競爭的緣故，就很容易消失於野外，但有些種類的適應性良好，就容易發展為入侵種 (invasive species)，造成生態浩劫，例如小花蔓澤蘭 (Mikania micrantha) 即為一例。
以上三者，即為分類學上的三種新，下次再看到可別搞錯囉～那今天就介紹到這裡，我們下次再見～
本文最初於2019.1.22刊登於同名專頁
小檗與十大功勞的百年爭議劃下句點
自十大功勞屬於1818年發表以來，各派學者百年來對於兩屬的分類地位一直有爭議。這個議題雖然多年來有學者試圖從不同角度探討，但並未獲得理想成果。近年來由台灣團隊所主持的一項國際研究案，針對兩屬進行廣泛的形態學與分子生物學的研究指出，小檗屬與十大功勞屬仍為不同的屬，而非如過去學者所謂屬於一廣義的小檗屬。作者在發表報告中表示，過去許多研究的採樣可能不夠廣泛或是使用了有問題的序列，所以導致研究成果不盡理想。有鑑於此，本次研究在採樣上特別加入先前忽略的種類，例如B. claireae以及十大功勞中sect. Horridae的成員。
這兩個過去未被注意到的類群，在形態上介於兩屬植物之間(同時具有單葉及複葉)，以及生長於獨特的乾燥環境中。本次研究的成果，將這兩個中間型的類群獨立為Alloberberis (異小檗屬)及Morano- thamnus(莫倫木屬)兩個新屬。這樣的架構之下，除了十大功勞屬外，其餘各屬都具有小枝，而小檗屬則是唯一僅為單葉的類群。 更詳細的資訊請參閱Taxon 2017. 66(6):1371-1392.
本文最初以圖片方式於2007.12.24發表於同名專頁